Podczas II wojny światowej w nocy 16/17 marca 1945 miał miejsce nalot brytyjski. Miasto, do tego momentu było prawie nietknięte przez wojnę, zostało zniszczone w 90%. Najważniejsze zabytki na obrzeżach miasta przetrwały, ale stare miasto zostało całkowicie zniszczone. Zginęło około 5 tys. mieszkańców miasta. Z militarnego punktu widzenia nalot na Würzburg prawdopodobnie nie miał sensu, gdyż miasto zostało zajęte przez Amerykanów w pierwszym tygodniu kwietnia 1945, tylko trzy tygodnie po nalocie.